广西合浦儒艮国家级自然保护区管理站成立于1996年，是儒艮保护区的管理机构，隶属广西壮族自治区环境保护局。保护区管理站与广西北海海洋环境监测中心站同一套班子，在广西北海海洋环境监测中心站下设广西合浦儒艮国家级自然保护区管理站办公室，具体负责保护区各项管理作。  
    因保护区管理及科研工作需要，广西合浦儒艮国家级自然保护区管理站在合浦县沙田镇设立分站，多年来，我站在资金很困难的情况下，积极争取国家环保局和广西区环保的支持，逐步完善保护区的配套基础设施建设和环境管理体制，使保护区的监督管理工作逐步走上规范化、法制化。
    2003年，完成保护区第一期管护工程——海上灯标4个、灯桩1个，明确了保护区的界限。2008年，建成保护区沙田管护站综合大楼，改善了保护区的办公、生活条件。此外，拥有宣传车、巡逻快艇、摄像机、GPS定位仪等设备，并在北海市合浦境内设立户外宣传广告牌15块，为保护区的监督管理提供了可靠的基础保障。